Pourquoi l’intestin est-il notre deuxième cerveau ? L'axe intestin cerveau

Et si ce que vous appeliez « intuition » n’était pas de l’instinct, mais un message de vos intestins ?

Votre intestin un deuxième cerveau : l'axe intestin-cerveau
Avec Julien Scanzi

Si vos humeurs instables, vos envies soudaines de chocolat, vos réveils maussades ou vos coups de stress… venaient d’un déséquilibre invisible, tapi dans vos intestins ?

Ce n’est pas une lubie new age. C’est ce que confirme une décennie de recherches scientifiques en neurogastroentérologie et en microbiologie : notre ventre pense, ressent, communique, et influence de manière fine et constante notre cerveau.

Sommaire
En bref
  • L’intestin, via son microbiote, dialogue en permanence avec votre cerveau grâce à un réseau dense de neurones et de messagers chimiques. C'est l'axe intestin-cerveau
  • Ce dialogue influence vos émotions, votre stress, votre humeur, votre mémoire… et peut même orienter certaines de vos décisions.
  • Vous pouvez agir concrètement pour soutenir cet équilibre subtil et optimiser votre bien-être global.

Un réseau neuronal autonome dans votre deuxième cerveau : le système nerveux entérique

Votre intestin n’est pas qu’un tuyau utile à l'activité digestive. Il abrite environ 200 millions de neurones – une concentration quasi équivalente à celle d’un cerveau de chien. Ce réseau nerveux a même un nom : le système nerveux entérique (SNE).

Le rôle de l'intestin est beaucoup plus large qu'assurer la digestion

Il régule les mouvements intestinaux, l'assimilation des nutriments, les sécrétions, l’immunité locale… mais il est aussi capable de produire des réflexes autonomes et de traiter des informations sans passer par le cerveau.

Le nerf vague : une fonction centrale pour la lien intestin - cerveau

Et ce n’est pas tout : il est en communication constante avec le système nerveux central, via une autoroute ultra rapide — le nerf vague.

Ce nerf, souvent méconnu, transporte des milliers de signaux à chaque seconde. Mais contrairement à ce qu’on pourrait croire, la majorité de ces informations (près de 80 % !) montent de l’intestin vers le cerveau, et non l’inverse.

Autrement dit : ce n’est pas uniquement votre tête qui pilote. Votre ventre parle à votre cerveau, et parfois, il prend les commandes.

Conseil de l’expert

Notre intestin possède son propre réseau neuronal. Et qu’il héberge des trillions de micro-organismes, de bactéries formant un écosystème aussi fascinant que puissant : le microbiote intestinal.

Longtemps réduit à son rôle digestif, il s’impose aujourd’hui comme un organe à part entière, au point d’être surnommé « notre deuxième cerveau ». Mieux encore : certains études parlent d’un organe psychique, tant il agit sur nos émotions, notre comportement, notre rapport au monde.

Julien Scanzi
Hepato - gastroentérologue
Julien Scanzi

Sérotonine, dopamine : le rôle du microbiote dans la production des neurotransmetteurs

Le plus spectaculaire dans cette histoire ? Vos bactéries intestinales fabriquent ou régulent la production de neurotransmetteurs, ces messagers chimiques qui pilotent votre humeur, votre concentration, votre bien-être.

De nombreuses études ont montré par exemple que :

  • 90 % de la sérotonine, hormone de la sérénité et de la bonne humeur, est produite dans le tube digestif.
  • Certaines souches de Lactobacillus et Bifidobacterium synthétisent du GABA, un calmant naturel qui régule l’anxiété.
  • La dopamine, liée à la motivation, est en partie influencée par les métabolites issus de la fermentation bactérienne.

Des expériences menées sur des souris montrent qu’en modifiant leur microbiote, on modifie aussi leur comportement : elles deviennent plus exploratrices, plus timides ou plus stressées selon les bactéries qu’elles hébergent.

Chez l’humain, les premières études sur les psychobiotiques, des probiotiques ciblés pour améliorer l’équilibre émotionnel, sont prometteuses : réduction de l’anxiété, amélioration du sommeil, diminution du stress perçu.

Vos émotions ne seraient donc pas purement mentales. Elles ont aussi une origine microbienne.

Quelle est la relation entre l’intestin et le cerveau ?

C’est un cercle à double sens. 

L'influence du stress sur le microbiote

Lorsque votre niveau de stress augmente, votre ventre le ressent. Littéralement. Le stress augmente la perméabilité intestinale (le fameux « intestin poreux »), déséquilibre la flore et favorise l’inflammation.

Mais l’inverse est aussi vrai.

L'influence du microbiote et d'une dysbiose intestinale sur le stress et la santé et la dépression

Un microbiote déséquilibré ou dysbiose intestinale, fragilise votre système immunitaire, perturbe la production de neurotransmetteurs et nourrit un climat inflammatoire silencieux, qui influence :

  • la qualité du sommeil,
  • la résistance au stress,
  • la mémoire,
  • et même la production de cortisol, l’hormone du stress.

Les chercheurs parlent aujourd’hui d’une boucle intestin-cerveau-stress : un circuit fermé qu’il faut apprendre à désamorcer à la source.

Les découvertes récentes

Certaines souches probiotiques, dites psychobiotiques, ont montré des effets mesurables sur l’anxiété légère et la qualité du sommeil (Lactobacillus reuteri PBS072, Bifidumbacterium breve BB077).

  • Des chercheurs testent aujourd’hui l’effet des psychobiotiques dans la prévention des rechutes dépressives (ScienceDirect, 2025).
  • Une diversité microbienne élevée (mesurée par l’indice de Shannon) est corrélée à une meilleure résilience émotionnelle face au stress.

Soutenir l’axe intestin-cerveau au quotidien ou comment soigner de notre deuxième cerveau ?

Bonne nouvelle : ce système complexe, vous pouvez l’influencer chaque jour. Alors, quels sont vos meilleurs alliés pour améliorer votre microbiote et prendre soin de votre deuxième cerveau ?

Nourrissez les bonnes bactéries de votre ventre, votre deuxième cerveau

Optez pour une alimentation riche en fibres prébiotiques : légumes, légumineuses, fruits, céréales complètes, graines.

Ils nourrissent les bactéries productrices de butyrate, essentiel à la communication intestin-cerveau.

Faites le plein de ferments vivants

Ajoutez des aliments fermentés à vos repas : yaourt, kéfir, miso, kombucha, choucroute, kimchi.

Ils introduisent des micro-organismes utiles à votre flore.

Augmentez les polyphénols

Baies, cacao brut, thé vert... : ces composés végétaux favorisent la croissance des bactéries anti-inflammatoires.

Bougez régulièrement améliore votre microbiote

L’exercice physique (même modéré) stimule la diversité microbienne et diminue l’inflammation et du stress chronique. 

Dormir mieux préserve la flore intestinale

Un bon sommeil améliore la communication de l'axe intestin-cerveau, favorise la récupération nerveuse et soutient l’équilibre émotionnel. Apprendre comment bien dormir est important pour préserver votre équilibre.

Apprenez à vous détendre et à gérer votre stress

Respiration, cohérence cardiaque, méditation, nature… Chaque moment de calme favorise la gestion du stress et un microbiote serein.

Envisagez les psychobiotiques : des compléments alimentaires pour retrouver l'équilibre émotionnel et intestinal

Le stress chronique, les troubles du sommeil ou encore les bouleversements émotionnels ont bien souvent un point commun insoupçonné : un déséquilibre du microbiote intestinal. C’est là qu’interviennent les psychobiotiques, une nouvelle génération de probiotiques capables d’agir sur le système nerveux via l’axe intestin-cerveau.

Le psychobiotique Nutri&Co

Le probiotique stress : le psycobiotique Nutri&Co
Le probiotique stress : le psycobiotique Nutri&Co

Dans le probiotique Stress Nutri&Co, nous avons associé deux souches (Lactobacillus helveticus R0052 et Bifidobacterium longum R0175) à l'efficacité démontrée par plusieurs études cliniques, notamment sur :

  • la réduction du stress, de l’anxiété légère,
  • l'atténuation des troubles du sommeil
  • et la gestion des manifestations digestives liées aux émotions (comme les ballonnements ou les crampes).

Résultat ? Un microbiote plus équilibré, une sensation de calme retrouvée et une approche 100 % naturelle pour prendre soin de sa santé mentale… depuis votre ventre.

Les découvertes récentes sur l’axe microbiote-intestin-cerveau

Depuis 2023, plusieurs travaux ont approfondi le rôle du microbiote intestinal dans la régulation du système nerveux central.

Des études humaines récentes ont mis en lumière trois mécanismes majeurs :

  • Les métabolites bactériens ou postbiotiques, comme les acides gras à chaîne courte (butyrate, propionate, acétate) sont capables d’influencer directement la perméabilité de la barrière hémato-encéphalique.
  • Le nerf vague, véritable autoroute électrochimique, permet aux signaux intestinaux d’influencer la production cérébrale de neurotransmetteurs.
  • Le stress oxydatif et de l’inflammation neuronale peuvent être modulés par certaines souches probiotiques (notamment Lactobacillus rhamnosus et Bifidobacterium longum).

En résumé, nos bactéries intestinales ne se contentent pas d’aider à digérer : elles participent à la communication neuronale et à la régulation émotionnelle.

Un enjeu de santé publique et un levier de bien-être durable

Ce que nous enseignent les dernières avancées de l’INSERM, du CNRS et de la recherche internationale, c’est que la santé mentale ne se joue pas que dans la tête. Elle se tisse dans vos cellules, vos bactéries, votre assiette, vos routines.

Prendre soin de son microbiote, ce n’est pas céder à une mode santé. C’est entrer dans une vision globale du bien-être, ancrée, durable, scientifique. En cultivant ce dialogue intime entre vos intestins et votre cerveau, vous devenez le pilote de votre équilibre émotionnel et mental.

Alors, et si vous commenciez à écouter votre ventre autrement ? Il ne parle peut-être pas avec des mots… mais il a beaucoup à vous dire !

Vos questions, nos réponses

Nos experts répondent à toutes vos questions.

Il existe un lien étroit entre nos intestins et notre santé mentale. Les neurotransmetteurs essentiels comme la sérotonine (90% produite dans l'intestin), la dopamine et le GABA sont largement fabriqués par notre microbiote intestinal. Ce sont eux qui influence directement notre humeur, notre stress et notre bien-être émotionnel.

Le microbiote intestinal régule la digestion, produit 90% de la sérotonine, synthétise des neurotransmetteurs comme le GABA, influence l'humeur, le stress et communique constamment avec le cerveau via l'axe intestin-cerveau.

Consommez des fibres prébiotiques, aliments fermentés et polyphénols. Pratiquez une activité physique régulière, gérez votre stress, dormez suffisamment et envisagez des psychobiotiques pour équilibrer votre microbiote intestinal en cas de stress et de difficulté d'endormissement.

Le nerf vague est le principal canal de communication entre l'intestin et le cerveau. Ce nerf crânien transporte 80% des signaux du ventre vers le cerveau, formant l'autoroute de l'axe intestin-cerveau.

Le nerf vague régule la digestion, transmet les signaux du microbiote au cerveau, influence la production de neurotransmetteurs et coordonne la réponse anti-inflammatoire. Il pilote notre "deuxième cerveau" intestinal.

Routine associée
*Références :

Publications et études sur le microbiote et l'axe intestin cerveau

Rédigé par l'équipe Nutri&Co

Notre équipe scientifique est composée d'un Diététicien, d'un Docteur en Sciences de la Nutrition d'Ingénieur en Nutrition et Science des Aliments et d'un Naturopathe.

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